Stroberi adalah tanaman gurita: genomnya memiliki delapan salinan kromosom, dengan empat subgenom berbeda. Ini jauh dari pemegang rekor: pohon blackberry memiliki 44 salinan dari tujuh kromosomnya.
Seperti manusia, sebagian besar organisme yang bereproduksi secara seksual juga demikian diploidyang berarti mereka memiliki dua salinan kromosom — satu dari ibu dan satu lagi dari ayah.
Namun, pada tumbuhan, segala sesuatunya bisa menjadi sangat buruk lebih rumitdan beberapa spesies, termasuk banyak tanaman pertanian, memiliki banyak salinan kromosom.
Misalnya stroberi budidaya yang Anda beli di supermarket (Fragaria × nanas) mereka guritayang berarti mereka punya delapan salinan kromosom.
Tapi bagaimana mereka memperoleh genom yang sedemikian kompleks?
Spesies tumbuhan poliploid Mereka memperoleh kromosom ekstra melalui dua proses berbeda: autopoliploidi dan halopoliploidi.
Spesies autopoliploid memang memilikinya banyak salinan kromosomnya sendiri, sedangkan spesies allopolyploid berasal dari hibridisasi di mana dua set kromosom berbeda digabungkan menjadi satu organisme, yang seringkali menjadi spesies baru.
Meskipun genom mereka bertahan di tanaman allopolyploid modernsementara itu, spesies yang menyumbangkan materi genetiknya kepada organisme ini mungkin juga memilikinyaeh-se punahyang membuatnya sangat sulit untuk mengungkap genom alopoliploid seperti stroberi.
Untuk lebih memahami bagaimana stroberi memperoleh delapan salinan kromosomnya, tim ahli genetika di Portland State University mempelajarinya retrotransposon pengulangan terminal genom yang panjang.
Elemen genetik kecil ini adalah fragmen DNA yang berulang yang dapat diduplikasi dan disisipkan ke bagian lain dari genom, jelasnya Nautilus. Dengan menganalisis pola sebarannya, peneliti dapat memperoleh gambaran lebih jelas tentang sejarah evolusi tumbuhan.
Dengan menerapkan metode baru ini pada stroberi, yang disajikan dalam a artikel diterbitkan di majalah tersebut Penelitian Hortikulturapenyidik dapat memastikan beberapa hal.
Pertama, penulis penelitian menyimpulkan bahwa genom stroberi terdiri dari empat subgenom yang berbeda (yang masuk akal mengingat guritanya).
Mereka juga menyimpulkan bahwa stroberi dibudidayakan secara modern melewati tiga peristiwa hibridisasi berbeda, yang terjadi sekitar 3 hingga 4, 2 hingga 3, dan 1 hingga 2 juta tahun yang lalu.
“Pekerjaan ini menunjukkan bagaimana elemen transposabel dapat berfungsi sebagai penanda temporal evolusioner yang dimasukkan ke dalam genom tanaman,” jelas penulis penelitian dalam sebuah pernyataan yang diterbitkan di Peringatan Eurek.
“Dengan fokus pada kapan dan di mana elemen-elemen ini berkembangkita dapat merekonstruksi sejarah genom bahkan ketika referensi nenek moyang langsung hilang”, tambah para peneliti.
Penemuan-penemuan baru ini telah terjadi implikasi penting bagi pertanian dan pemuliaan tanaman, termasuk gandum, tebu dan kapas.
Dan jika Anda sekarang bertanya-tanya di mana peringkat stroberi oktoploid di antara tanaman poliploid… mereka masih jauh dari pemegang rekor yang diketahui saat ini: murbei hitam memiliki 44 salinan dari tujuh kromosomnyayang menjadikannya tanaman tetratetracontaploide.
