Love Dalén, Peter Mortensen / University of Stockholm
Sisa -sisa gigi mammoth
Teknik sekuensing genetik mengungkapkan DNA 310 spesies mikroba yang terkait dengan inang yang lebih tua yang pernah terdaftar: dalam sampel gigi dan tulang rawan daun dan mammute kuil.
Analisis tulang dan gigi mammoth prasejarah (Mammuthus) diizinkan mengidentifikasi beberapa mikroorganisme yang telah mendiami mulut dan tubuh hewan -hewan ini satu juta tahun.
HAI belajarditerbitkan pada hari Selasa di majalah sel, menggambarkan DNA mikroba tertua yang pernah diurutkan, dan menunjukkan bahwa spesies bakteri patogen tertentu saat ini terkait dengan kematian gajah Afrika (Loxodonta Afrika), mereka sudah menginfeksi sepupu mereka yang jauh.
Kesimpulannya menawarkan “peluang bagus untuk mendapatkan pandangan global tentang jenis bakteri atau virus apa yang bisa kita temukan pada spesies yang punah ini,” jelasnya Alam o Paleomicrobiologista Benjamin GuinetPenyelidik Pusat Palaeogenektik, di Stockholm, penulis pertama penelitian.
Penelitian di masa depan dapat membantu Anda menyadari bagaimana mikroorganisme berkontribusi pada adaptasi hewan -hewan ini ke berbagai lingkungan dan jika memainkan beberapa peran dalam kepunahan mereka.
Mikroba patogen
Sejauh ini, investigasi pada sisa-sisa lama telah berfokus terutama pada DNA manusia dan mikroorganisme terkait manusia, menjadi penelitian langka pada mikroba dan inang pada hewan prasejarah.
Untuk mengeksplorasi hubungan antara mammoth dan mikroorganisme, tim menganalisis DNA mikroba kuno Diekstraksi dari gigi, tengkorak dan kulit dari 483 spesimen.
Cover fosil beberapa lokasi geografis -Dari Amerika Utara dan Inggris ke Siberia dan berasal dari awal Pleistosen, sekitar satu juta tahun yang lalu, hingga kepunahan mammoth terakhir pulau Wrangel (di luar Siberia), yang sudah ada di Holocene, sekitar 4.000 tahun yang lalu.
Para peneliti diidentifikasi 310 spesies mikroba terkait dengan jaringan mammoth. Banyak yang berasal dari lingkungan dan akan menjajah jasad setelah kematian hewan, jadi tim menyaring DNA ini “Post Mortem“Berkonsentrasi pada bakteri yang menghuni mammoth dalam kehidupan.
Menggunakan Skrining metagenomikTeknik sekuensing yang memungkinkan Anda untuk menganalisis bahan genetik dalam sampel yang terdiri dari genom organisme berganda, para ilmuwan mempelajari DNA yang ada dalam fosil.
Lalu lewat inferensi filogenetikmereka membandingkan urutan ini dengan bakteri modern untuk mengidentifikasi genre mikroba.
Analisis terungkap Enam kelompok mikroorganisme terkait dengan host, beberapa di antaranya akan menyebabkan penyakit pada mammakes.
Di antara mereka ada tekanan dekat Actinobacillusyang sebelumnya terisolasi pada babi (Babi domestik) dan mana yang mungkin mengintegrasikan mikrobioma raksasa oral.
Genre ini juga diidentifikasi Pasteurellaterkait erat dengan a Patogen terkait dengan kematian lusinan gajah Afrika Di Botswana dan Zimbabué pada tahun 2020. Dalam hal ini, bakteri menginfeksi mulut hewan sebelum memasuki aliran darah dan menyebabkan septikemia yang fatal.
Tim ini juga membangun kembali genom dari keluarga bakteri yang disebut Erysipelothrixdari sampel empat raksasa daun dan DNA mikroba berusia 1,1 juta tahun yang terkait dengan inang tertua di mana ia dicatat.
Berbeda dengan kelompok bakteri lainnya, hanya ada dalam sel gigi, mikroorganisme ini Itu juga terdeteksi dalam jaringan tulang.
Mikrobioma kuno
Efek konkret dari koloni bakteri ini pada kesehatan raksasa sulit untuk ditentukan hanya pada analisis genetik ini. Namun, peneliti menekankan bahwa pekerjaan menawarkan pandangan pertama mikroba yang menghuni hewan prasejarah.
GEIGL EVA-MARIAahli paleogenetik di Institut Jacques Monod, di Paris, mempertanyakan Relevansi analisis biologis sampel lebih dari satu juta tahun, mengingat kurangnya referensi yang tepat untuk perbandingan. Tetapi dia mengakui bahwa tim “tentu saja melakukan pekerjaan dengan baik dan menghasilkan sejumlah besar data.”
“Artikel menunjukkan bukti konsep yang bagus: Bahkan beberapa bakteri yang sangat tua dapat dipulihkan secara genetik, ”tambahnya.
Temuan ini memberikan dasar untuk investigasi di masa depan terhadap mikrobioma lama dan dampaknya terhadap kesehatan dan penyakit, para penulis menyimpulkan. “Sangat menarik untuk dapat menceritakan kisah ini. Kami ingin membuka Kitab Kehidupan dan memperluas batasan dari apa yang bisa kita ketahui, ”merangkum Guinet.
